Sihtasutus Juuru ja Hageri Kihelkonna Muuseumid loodi Mahtra Talurahvamuuseumi baasil 2013. aastal Eesti Vabariigi Kultuuriministeeriumi ning Juuru ja Kohila valla koostöös. Sihtasutuse suurim struktuuriüksus ja asukoht on Mahtra Talurahvamuuseum Juuru alevikus.